More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2396 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  80.06 
 
 
361 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  78.67 
 
 
361 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.94 
 
 
361 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.73 
 
 
361 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  81.72 
 
 
361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.9 
 
 
361 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  76.37 
 
 
365 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  77.07 
 
 
362 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  75.41 
 
 
362 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  76.18 
 
 
361 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  75.41 
 
 
362 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  75.41 
 
 
362 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  75.9 
 
 
361 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.13 
 
 
366 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.52 
 
 
361 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.85 
 
 
361 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  74.45 
 
 
364 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.07 
 
 
362 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.93 
 
 
363 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  72.53 
 
 
364 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.68 
 
 
363 aa  521  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  75.07 
 
 
361 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  74.2 
 
 
380 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.34 
 
 
366 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.24 
 
 
372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  71.06 
 
 
366 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
363 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.5 
 
 
362 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  64.82 
 
 
574 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  62.98 
 
 
366 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  44.38 
 
 
359 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.4 
 
 
368 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
362 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
366 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.33 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
361 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  42.21 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.28 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.47 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.4 
 
 
368 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.15 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
360 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.41 
 
 
359 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
369 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
363 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
369 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 
367 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
365 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
372 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  34.36 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
363 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.75 
 
 
372 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
374 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
374 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
369 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  38.01 
 
 
361 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
363 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.59 
 
 
369 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
373 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
377 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.23 
 
 
366 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3672  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
366 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618419  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.11 
 
 
385 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
367 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.29 
 
 
382 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.71 
 
 
368 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
373 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.68 
 
 
382 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
369 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
385 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
379 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
373 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.23 
 
 
369 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
379 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
379 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
373 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5114  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
369 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
371 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 
363 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
376 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 
358 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.73 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.76 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.01 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.14 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.86 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6311  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6016  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.917208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.59 
 
 
370 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
403 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
370 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  36.39 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  36.67 
 
 
372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>