More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  100 
 
 
381 aa  754    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.14 
 
 
381 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1454  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.49 
 
 
371 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 
360 aa  250  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
362 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
362 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
351 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 
348 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
362 aa  223  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
361 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.2 
 
 
375 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
361 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
361 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
366 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
380 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
385 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
373 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  35.44 
 
 
364 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
379 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
379 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
379 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.96 
 
 
375 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
375 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
363 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.87 
 
 
375 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  35.92 
 
 
361 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
361 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
373 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
375 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.12 
 
 
377 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  35.16 
 
 
372 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.71 
 
 
366 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.44 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.69 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.99 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
375 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.98 
 
 
372 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.15 
 
 
382 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  33.7 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
361 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  33.15 
 
 
382 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
361 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
370 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.24 
 
 
361 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
374 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
368 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.07 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
373 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.33 
 
 
372 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  32.97 
 
 
376 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.32 
 
 
361 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
368 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
368 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
368 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.99 
 
 
372 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
365 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
370 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.97 
 
 
368 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  33.24 
 
 
376 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
376 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
374 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.32 
 
 
370 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
376 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  33.7 
 
 
370 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
368 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 
363 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
362 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  33.24 
 
 
376 aa  176  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.79 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  34.67 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  35.16 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  32.87 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.51 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.51 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  32.24 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.52 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>