More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3153 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  766    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
368 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5034  alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 
368 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4651  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.02 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4739  alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4959  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.78 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3194  alcohol dehydrogenase  50.4 
 
 
368 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3182  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.4 
 
 
368 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3244  alcohol dehydrogenase  50.4 
 
 
368 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5074  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
370 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4689  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.08 
 
 
370 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4775  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
370 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142879  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5270  alcohol dehydrogenase  50.54 
 
 
370 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1486  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
370 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.94 
 
 
385 aa  346  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4948  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.27 
 
 
375 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.12 
 
 
370 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  47.98 
 
 
368 aa  338  9e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.85 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1593  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
376 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0013  alcohol dehydrogenase  51.87 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.798633  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0127  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0137  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0146  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625258  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10776  zinc-type alcohol dehydrogenase NAD dependent adhB  43.28 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.51 
 
 
368 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3128  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.24 
 
 
376 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4492  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.65 
 
 
375 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4968  alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
375 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4585  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.97 
 
 
375 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4673  alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
375 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4041  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
369 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.85 
 
 
372 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
376 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.53 
 
 
370 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
375 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  40.58 
 
 
379 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  40.32 
 
 
376 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
374 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.2 
 
 
369 aa  255  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  41.11 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  41.38 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  40.37 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
368 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
368 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.79 
 
 
375 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  39.63 
 
 
369 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.21 
 
 
376 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.2 
 
 
368 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
368 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.95 
 
 
376 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
370 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  40.05 
 
 
376 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.69 
 
 
370 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.99 
 
 
384 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
368 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
370 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.36 
 
 
370 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.89 
 
 
370 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 
376 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
376 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
376 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.67 
 
 
368 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.56 
 
 
374 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
376 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
370 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.16 
 
 
371 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
376 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
370 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
369 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2166  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
369 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
368 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
368 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  39.79 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.99 
 
 
382 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  38.99 
 
 
382 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  39.36 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.3 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
373 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
368 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
372 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>