More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4492 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4492  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
375 aa  764    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  54.67 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1593  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
376 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3128  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.99 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4959  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.26 
 
 
383 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10776  zinc-type alcohol dehydrogenase NAD dependent adhB  50.67 
 
 
375 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0137  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.39 
 
 
374 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0127  alcohol dehydrogenase  52.39 
 
 
374 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0146  alcohol dehydrogenase  52.39 
 
 
374 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625258  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4968  alcohol dehydrogenase  52.66 
 
 
375 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4585  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.66 
 
 
375 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4673  alcohol dehydrogenase  52.66 
 
 
375 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 
368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5034  alcohol dehydrogenase  49.73 
 
 
368 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5270  alcohol dehydrogenase  49.6 
 
 
370 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5074  alcohol dehydrogenase  49.33 
 
 
370 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4689  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.33 
 
 
370 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4775  alcohol dehydrogenase  49.33 
 
 
370 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142879  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4651  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.46 
 
 
368 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4739  alcohol dehydrogenase  49.46 
 
 
368 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  47.84 
 
 
368 aa  349  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.98 
 
 
372 aa  348  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3194  alcohol dehydrogenase  50.81 
 
 
368 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3182  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.81 
 
 
368 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3244  alcohol dehydrogenase  50.81 
 
 
368 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1486  alcohol dehydrogenase  49.6 
 
 
370 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4948  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.87 
 
 
375 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4041  alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 
377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 
375 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0013  alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.798633  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.38 
 
 
368 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.53 
 
 
385 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.27 
 
 
370 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
368 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
372 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.6 
 
 
372 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  37.96 
 
 
368 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.65 
 
 
368 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.28 
 
 
379 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
368 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.81 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
368 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.91 
 
 
368 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
379 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
379 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
376 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
379 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
368 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
368 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.28 
 
 
377 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  37.17 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.28 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
379 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
373 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
368 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
379 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
379 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
359 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.73 
 
 
375 aa  215  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.73 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.09 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0713  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase(FlhA)  35.56 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.009216  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.75 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.75 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
369 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0536  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.14 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
369 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  36.56 
 
 
361 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
373 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
373 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
374 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0103  alcohol dehydrogenase class III/S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.81 
 
 
370 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
376 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
375 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
383 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.75 
 
 
370 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  34.75 
 
 
376 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
373 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4639  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
369 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.22 
 
 
376 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2495  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
369 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.11 
 
 
369 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
366 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
374 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0803  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
368 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0246485  normal  0.0104055 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  33.42 
 
 
376 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.16 
 
 
376 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
376 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>