More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0120 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  87.24 
 
 		 342 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  86.35 
 
 		 342 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.53 
 
 		 342 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.06 
 
 		 342 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.26 
 
 		 341 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  76.04 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  74.41 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  75.44 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  75.44 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  75.44 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.67 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.67 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73.67 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.67 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.67 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73.67 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  74.41 
 
 		 348 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  74.71 
 
 		 341 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  73.53 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  72.94 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73 
 
 		 343 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  72.06 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.94 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  74.41 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  71.81 
 
 		 344 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  72.4 
 
 		 343 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  71.35 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.76 
 
 		 341 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.05 
 
 		 344 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.05 
 
 		 344 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  76.35 
 
 		 338 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  70.88 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  71.93 
 
 		 344 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.65 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  66.76 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.37 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  62.94 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.65 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  65.18 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.35 
 
 		 340 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  64.5 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  62.17 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.69 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  61 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  61.72 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  59.53 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.06 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.69 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.25 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  55.65 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  54.41 
 
 		 341 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.41 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  54.41 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 350 aa  297  1e-79  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 347 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.31 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.1 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.18 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  43.55 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1776  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1598  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1683  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  42.35 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1681  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  45.7 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02286  Alcohol dehydrogenase 3 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase III)(ADH III) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P07754]  44.44 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 336 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  48.4 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.4 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08979  Alcohol dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase I)(ADH I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08843]  42.32 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.27 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>