More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0523 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  711    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.3 
 
 
350 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 
350 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.88 
 
 
350 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
350 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.17 
 
 
347 aa  258  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
356 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
349 aa  247  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
349 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
357 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
352 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.57 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
352 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34 
 
 
352 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  34.86 
 
 
352 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
347 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
352 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
344 aa  202  9e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
342 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
351 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
341 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.17 
 
 
346 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
347 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.06 
 
 
353 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.28 
 
 
341 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
346 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
344 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.64 
 
 
349 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
341 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.9 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
341 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
336 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.64 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.75 
 
 
344 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
340 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
342 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
356 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.81 
 
 
342 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.06 
 
 
351 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.67 
 
 
342 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
340 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
343 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
335 aa  177  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
341 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.62 
 
 
337 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
338 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
348 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
343 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
342 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 
328 aa  175  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  33.72 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.98 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
336 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
336 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
342 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.14 
 
 
341 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.82 
 
 
344 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.82 
 
 
344 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
342 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
342 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
342 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
344 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.39 
 
 
341 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.99 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.99 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.99 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.99 
 
 
357 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.99 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.99 
 
 
341 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
346 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
347 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
336 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
348 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.82 
 
 
342 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
341 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
338 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
341 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
348 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.8 
 
 
341 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.53 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>