More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1693 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  91.55 
 
 
344 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  98.25 
 
 
343 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
343 aa  699    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  84.41 
 
 
342 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  86.18 
 
 
342 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  81.52 
 
 
342 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  80.77 
 
 
347 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  81.58 
 
 
344 aa  567  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  80.06 
 
 
344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  80.06 
 
 
344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.07 
 
 
342 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  79.18 
 
 
344 aa  557  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  79.35 
 
 
348 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.24 
 
 
341 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.49 
 
 
342 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  77.51 
 
 
342 aa  547  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  75.15 
 
 
344 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  73.45 
 
 
341 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  73.81 
 
 
342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  72.57 
 
 
341 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  73 
 
 
340 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  72.78 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  72.49 
 
 
342 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.29 
 
 
341 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.39 
 
 
341 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  72.62 
 
 
342 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  72.57 
 
 
357 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  72.92 
 
 
342 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  72.62 
 
 
342 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.24 
 
 
342 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  73.95 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  67.74 
 
 
342 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  65.98 
 
 
342 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  66.47 
 
 
344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.69 
 
 
337 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  63.88 
 
 
337 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  62.69 
 
 
340 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  63.13 
 
 
341 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.49 
 
 
340 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.47 
 
 
342 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  60.65 
 
 
343 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.58 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63 
 
 
368 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  58.36 
 
 
344 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 
344 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.38 
 
 
336 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  55.95 
 
 
336 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  54.1 
 
 
341 aa  358  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.82 
 
 
336 aa  358  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 
336 aa  351  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
341 aa  346  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
350 aa  300  3e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
338 aa  275  7e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
340 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.88 
 
 
335 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
345 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
347 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
336 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
336 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
345 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
345 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  40.64 
 
 
348 aa  259  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
350 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
347 aa  258  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08979  Alcohol dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase I)(ADH I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08843]  43.68 
 
 
350 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
380 aa  256  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
342 aa  256  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
336 aa  255  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02286  Alcohol dehydrogenase 3 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase III)(ADH III) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P07754]  43.86 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264256  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
348 aa  250  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
340 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1598  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1683  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1776  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1681  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
336 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
336 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
336 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
336 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
336 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 
336 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00710  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  40.97 
 
 
361 aa  236  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  43.32 
 
 
336 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>