More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3142 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 346 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.65 
 
 		 346 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.76 
 
 		 348 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.7 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  56.69 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  52.91 
 
 		 360 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.31 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  56.52 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.52 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  56.52 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.57 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.29 
 
 		 349 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.74 
 
 		 347 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.22 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.37 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.36 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.38 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.96 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.7 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.87 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.03 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.47 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 		 381 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.86 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.06 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.86 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.66 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  30.36 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.99 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.9 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.19 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59150  secondary alcohol dehydrogenase (SADH1)  30.79 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318338  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  33.52 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.46 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>