More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0543 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
347 aa  690    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  56.2 
 
 
347 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  55.62 
 
 
347 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  55.33 
 
 
347 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.52 
 
 
353 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  55.33 
 
 
347 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.74 
 
 
342 aa  342  8e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.13 
 
 
341 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.59 
 
 
341 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.86 
 
 
341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.99 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  48 
 
 
364 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
364 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
341 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.41 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.99 
 
 
344 aa  295  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.11 
 
 
347 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.87 
 
 
349 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
344 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
356 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.54 
 
 
346 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.62 
 
 
346 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
349 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  39.46 
 
 
348 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
354 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
348 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.8 
 
 
343 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
347 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
347 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.34 
 
 
347 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.81 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  38.67 
 
 
341 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 
349 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
346 aa  179  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.53 
 
 
349 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.12 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.65 
 
 
348 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
335 aa  170  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
328 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  36.61 
 
 
360 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
344 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.95 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.99 
 
 
347 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
344 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
344 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
343 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
342 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
351 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
341 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
330 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
344 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
338 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.71 
 
 
342 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.18 
 
 
341 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
350 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
337 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.63 
 
 
344 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.63 
 
 
344 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.29 
 
 
342 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
324 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
356 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.51 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.44 
 
 
342 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.94 
 
 
341 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
341 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
347 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
342 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
341 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34 
 
 
336 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
344 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.13 
 
 
341 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
350 aa  149  5e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 
342 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
344 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.38 
 
 
336 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.63 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.45 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.23 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.23 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.23 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.23 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 
331 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.45 
 
 
329 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
353 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
336 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>