More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3557 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 341 aa  680    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.42 
 
 		 341 aa  531  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.01 
 
 		 341 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.33 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.22 
 
 		 342 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.31 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.11 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  55.33 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  54.76 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  55.93 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  56.2 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.27 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.55 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.22 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.33 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  35.9 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.14 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.68 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  34.01 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.02 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.4 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.6 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.04 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.83 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.24 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.78 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.07 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.07 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.07 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.66 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.07 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.65 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>