More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2514 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 341 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.33 
 
 		 341 aa  481  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.79 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.5 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.45 
 
 		 342 aa  454  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.6 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.87 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  60.81 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  63.11 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  61.96 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.73 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.8 
 
 		 347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.01 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.49 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.71 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.66 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.62 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.6 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.32 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  36.57 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.35 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  39.26 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.56 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.39 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.9 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.76 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.95 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.97 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.1 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.3 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.96 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.67 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.58 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.58 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.84 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.2 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.67 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.11 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.26 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.67 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  30.36 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>