More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3405 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
347 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.9 
 
 
349 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  61.89 
 
 
354 aa  391  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.36 
 
 
346 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.47 
 
 
346 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  52.17 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.45 
 
 
346 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.91 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  52.01 
 
 
348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.43 
 
 
348 aa  322  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.86 
 
 
349 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  52.57 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
341 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.14 
 
 
347 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.77 
 
 
341 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.62 
 
 
346 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 
341 aa  222  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.02 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.04 
 
 
341 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
347 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.02 
 
 
342 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.92 
 
 
353 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
341 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.72 
 
 
347 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.82 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
356 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
347 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
350 aa  192  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
346 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.37 
 
 
347 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
347 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
364 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
364 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.92 
 
 
349 aa  185  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
349 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
344 aa  177  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  32.54 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
341 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
338 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.96 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
337 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
338 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
344 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
350 aa  158  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.05 
 
 
381 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
343 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.95 
 
 
344 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 
341 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.95 
 
 
344 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.38 
 
 
342 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
342 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
342 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
340 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
350 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
336 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
336 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
355 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
341 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
344 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.85 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.62 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 
340 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.62 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
344 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.17 
 
 
328 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
344 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
352 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
349 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
338 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.61 
 
 
348 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
342 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 
341 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.29 
 
 
347 aa  143  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.62 
 
 
341 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
344 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32 
 
 
342 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
342 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
342 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.13 
 
 
350 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.55 
 
 
337 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
350 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
365 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>