More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2098 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.42 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.85 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  44.86 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.52 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.23 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  42.24 
 
 		 352 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.47 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.19 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.74 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.21 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  36.06 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.81 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.81 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.43 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.99 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.9 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.99 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 344 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.84 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 344 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.4 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.51 
 
 		 344 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  35.26 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.98 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.29 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.49 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.94 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.78 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.29 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.73 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.73 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.46 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>