More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3345 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  707    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 		 352 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.82 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.11 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  47.84 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  44.86 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 352 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.59 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.87 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 349 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.32 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.37 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.99 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.08 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.53 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.24 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.99 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.14 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.12 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.77 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.58 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.67 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.53 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.67 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.38 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.48 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.67 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.67 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.48 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.67 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.67 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.67 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.49 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.56 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.34 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>