More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2346 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 352 aa  723    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  80.4 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  80.11 
 
 		 352 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  81.53 
 
 		 352 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  80.68 
 
 		 352 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  75.85 
 
 		 351 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 349 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.75 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.18 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.23 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.96 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.48 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.01 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.01 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.2 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.73 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.73 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.73 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.11 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.73 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.48 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.64 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.25 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.64 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.34 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.55 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.25 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.41 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.08 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.78 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.93 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.46 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.78 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.16 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.8 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>