More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2945 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  75.3 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  64.48 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  64.5 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  53.71 
 
 		 342 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  51.63 
 
 		 342 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.82 
 
 		 343 aa  351  8e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.82 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.34 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  52.24 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.52 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  50.74 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  51.04 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.03 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.03 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.23 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 		 348 aa  338  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 341 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.24 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.55 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  51.94 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 		 342 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.04 
 
 		 342 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 		 342 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  50.74 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.23 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.94 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.94 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.94 
 
 		 357 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.94 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.94 
 
 		 341 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.94 
 
 		 341 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  51.04 
 
 		 341 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  50.59 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.26 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.26 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.48 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 342 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  52.24 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.48 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.15 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.54 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  45.91 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 345 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  42.9 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1776  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1598  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1683  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1681  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08979  Alcohol dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase I)(ADH I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08843]  37.35 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>