More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2474 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 352 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  93.75 
 
 		 352 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  92.33 
 
 		 352 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  84.09 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  82.95 
 
 		 351 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  80.4 
 
 		 352 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  41.13 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.62 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.13 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 		 352 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.61 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.21 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.4 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.4 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.4 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.4 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.36 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.12 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.12 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.78 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.55 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.12 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.31 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.16 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.01 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.01 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.16 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.42 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.03 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.03 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.42 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.39 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.85 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.21 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 		 337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.03 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.8 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  32.2 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>