More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5563 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 		 349 aa  281  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.99 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.09 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.8 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.83 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  41.67 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 351 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.4 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  36.77 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.4 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.69 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.23 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.76 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  34.01 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.53 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.78 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.7 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.2 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.32 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.89 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.06 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.5 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  31.5 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.13 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.4 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>