More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3494 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
341 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.42 
 
 
341 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.42 
 
 
341 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.79 
 
 
341 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.34 
 
 
342 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.46 
 
 
353 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.82 
 
 
341 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 
347 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  59.15 
 
 
347 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  58.54 
 
 
347 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  56.48 
 
 
347 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.15 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.17 
 
 
346 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.63 
 
 
347 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.9 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.82 
 
 
349 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.37 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.43 
 
 
343 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
354 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  37.54 
 
 
348 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
356 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
346 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 
337 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
350 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  36.31 
 
 
360 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
349 aa  185  9e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.04 
 
 
347 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
347 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
347 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
341 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.55 
 
 
349 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
346 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
342 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
340 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
342 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
348 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
342 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
342 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
341 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
336 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.99 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.24 
 
 
342 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.72 
 
 
328 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
324 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.69 
 
 
341 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.91 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.91 
 
 
357 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.91 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
341 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
344 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
343 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.91 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.91 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.2 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.2 
 
 
342 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.91 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.06 
 
 
347 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
347 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
342 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
343 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
336 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
342 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
336 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.21 
 
 
350 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
348 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
340 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.27 
 
 
336 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
356 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
338 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
350 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
344 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
342 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.22 
 
 
341 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.46 
 
 
341 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
344 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.88 
 
 
344 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.88 
 
 
344 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.65 
 
 
342 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
347 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>