More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0601 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  649    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.37 
 
 
328 aa  334  9e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.65 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
341 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
341 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
341 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 
342 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
341 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.17 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.76 
 
 
344 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
346 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.59 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
364 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
364 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
350 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
347 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
347 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
356 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0398  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
315 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.859369  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  33.99 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.69 
 
 
342 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
347 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.33 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.34 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  28.99 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
341 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
356 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
342 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
336 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
341 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.12 
 
 
337 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
344 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.32 
 
 
310 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.211345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
342 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.91 
 
 
342 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
344 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
342 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.92 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.12 
 
 
342 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
342 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.41 
 
 
342 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.24 
 
 
347 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.32 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.32 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.32 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.32 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.32 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.32 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
341 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  30.66 
 
 
348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.46 
 
 
344 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
337 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.46 
 
 
344 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.81 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.81 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.02 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.86 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 
342 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.94 
 
 
336 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
322 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
342 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.57 
 
 
342 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
342 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.31 
 
 
346 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.73 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  27.94 
 
 
336 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.5 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>