More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3627 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  85.59 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  79.54 
 
 		 347 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  77.52 
 
 		 347 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.11 
 
 		 341 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.46 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.76 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.06 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.76 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.33 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.16 
 
 		 341 aa  348  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.14 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  49.14 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.41 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.71 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.4 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.58 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.27 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 		 356 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  36.92 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.94 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.86 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.73 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.02 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 348 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.16 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.16 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.16 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.16 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.16 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.64 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.16 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.58 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.73 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.28 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.89 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.91 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.29 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.29 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  34.86 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.01 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.16 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.85 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.93 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>