More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  76.15 
 
 		 347 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.62 
 
 		 349 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.45 
 
 		 346 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  52.59 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.59 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  52.59 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.71 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.56 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.59 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.58 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  44.38 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.63 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  49.01 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 		 341 aa  262  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  42.07 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.89 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.03 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 347 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.19 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.23 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.46 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.64 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.61 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.36 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.01 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.41 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.32 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  31.12 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.81 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.73 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2151  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  33.06 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.66 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.09 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.48 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  34.84 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.13 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2823  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  34.77 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>