More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2363 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.9 
 
 
349 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.89 
 
 
347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  61.89 
 
 
347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  61.89 
 
 
347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.86 
 
 
346 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  49.86 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.86 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.14 
 
 
346 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  49 
 
 
360 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.44 
 
 
348 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.31 
 
 
348 aa  285  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.59 
 
 
349 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.63 
 
 
347 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
341 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.9 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.26 
 
 
341 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.54 
 
 
341 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.83 
 
 
353 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38 
 
 
341 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.41 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
364 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
364 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.25 
 
 
342 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.1 
 
 
341 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 
356 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
347 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
347 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
347 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
347 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
356 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.5 
 
 
347 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.18 
 
 
344 aa  189  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
349 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  33.93 
 
 
336 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
337 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
350 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
349 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
344 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
343 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
340 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.57 
 
 
337 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
341 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
338 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.36 
 
 
347 aa  156  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.08 
 
 
347 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
336 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
341 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.64 
 
 
342 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.19 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
344 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 
344 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.14 
 
 
344 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
348 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
344 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.38 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
342 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.93 
 
 
336 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
344 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.77 
 
 
342 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
345 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
343 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
344 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.04 
 
 
342 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
342 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.08 
 
 
368 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
347 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
343 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
345 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
341 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
350 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.7 
 
 
350 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
347 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.71 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
336 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
350 aa  146  6e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
342 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.71 
 
 
357 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>