More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1750 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
341 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.17 
 
 
353 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.11 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.94 
 
 
342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.57 
 
 
341 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.82 
 
 
341 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.87 
 
 
341 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  53.16 
 
 
347 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  52.01 
 
 
347 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 
347 aa  331  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.4 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  48.57 
 
 
364 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  48.57 
 
 
364 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.86 
 
 
347 aa  292  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.69 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.38 
 
 
347 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.82 
 
 
349 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.22 
 
 
346 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.79 
 
 
346 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  36.96 
 
 
348 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.68 
 
 
346 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 
348 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.77 
 
 
347 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
347 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 
354 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
347 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.39 
 
 
343 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 
349 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  38.81 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
346 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
347 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
344 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
348 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
341 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
350 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
337 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
344 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
342 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
341 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
341 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.19 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.15 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.8 
 
 
341 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
344 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
356 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
347 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
342 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.16 
 
 
335 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
324 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.67 
 
 
342 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
342 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
336 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.31 
 
 
357 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.31 
 
 
341 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
341 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
343 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
344 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.67 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
345 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.02 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
347 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.53 
 
 
344 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.53 
 
 
344 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
344 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
341 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.5 
 
 
342 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
347 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.46 
 
 
336 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
344 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
349 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
368 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
341 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>