More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2307 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 351 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  82.95 
 
 		 352 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  83.24 
 
 		 352 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  80.97 
 
 		 352 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80.97 
 
 		 352 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  75.85 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.14 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 350 aa  223  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.91 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.48 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.2 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.89 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.59 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.59 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.31 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.31 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.31 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.31 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.98 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.31 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.7 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.7 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  29.63 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.83 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.91 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.48 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.23 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.46 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.8 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.67 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.42 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.75 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.62 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00470  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.91 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.71 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  30.47 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  30.99 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>