More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4226 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  723    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  81.3 
 
 
353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.3 
 
 
353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  81.3 
 
 
353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.3 
 
 
364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.3 
 
 
364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.3 
 
 
364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  81.3 
 
 
353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.14 
 
 
345 aa  358  7e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
363 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.83 
 
 
351 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1825  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.1 
 
 
351 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.19 
 
 
356 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1821  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
344 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00641517  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.06 
 
 
345 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  30.92 
 
 
346 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.33 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.76 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
373 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.81 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.22 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  30.22 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  29.91 
 
 
342 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.19 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.96 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.92 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.63 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.7 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
337 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
340 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.23 
 
 
348 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.23 
 
 
342 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
358 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  30.12 
 
 
352 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.51 
 
 
329 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  32.05 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.92 
 
 
357 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
346 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  28.99 
 
 
340 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  30.03 
 
 
363 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
337 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.22 
 
 
341 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
338 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
351 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 
347 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
344 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  28.99 
 
 
340 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.15 
 
 
343 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
347 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
344 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.2 
 
 
346 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  27.93 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  29.65 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.09 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  32.73 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  28.27 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  30.05 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.09 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.24 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.86 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  30.99 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.82 
 
 
377 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.09 
 
 
377 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
342 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.4 
 
 
381 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
347 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  27.94 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  27.63 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  27.63 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.3 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.93 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.77 
 
 
341 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.2 
 
 
342 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.62 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
351 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>