More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0950 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.54 
 
 
347 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
347 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  79.48 
 
 
346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  76.38 
 
 
343 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  71.47 
 
 
349 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  67.92 
 
 
346 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  72.33 
 
 
349 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.79 
 
 
346 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.45 
 
 
346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  57.43 
 
 
338 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.2 
 
 
338 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  56.65 
 
 
363 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.03 
 
 
335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.74 
 
 
342 aa  328  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 
335 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.29 
 
 
348 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.2 
 
 
351 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.24 
 
 
344 aa  305  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.3 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.94 
 
 
344 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.45 
 
 
351 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.93 
 
 
345 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.38 
 
 
355 aa  292  6e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
340 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.04 
 
 
357 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.63 
 
 
351 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.3 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.19 
 
 
353 aa  275  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.49 
 
 
353 aa  272  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.25 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.35 
 
 
344 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.82 
 
 
365 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
361 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
350 aa  164  3e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.36 
 
 
337 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.5 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.5 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
342 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
342 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
344 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
349 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
341 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
336 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.41 
 
 
341 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
340 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
344 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
344 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
348 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
344 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
341 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
338 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.05 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.05 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
342 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
343 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.76 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
341 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.92 
 
 
341 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 
368 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.16 
 
 
342 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 
341 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
343 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
360 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.26 
 
 
341 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
347 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
381 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.81 
 
 
342 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
342 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.21 
 
 
344 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.23 
 
 
342 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.38 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
343 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.58 
 
 
346 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
341 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
342 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
338 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.75 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.81 
 
 
344 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
342 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
348 aa  132  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  33.43 
 
 
359 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>