More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4805 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
351 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  58.52 
 
 
350 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.85 
 
 
346 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.29 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  48.49 
 
 
346 aa  325  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.58 
 
 
347 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.74 
 
 
338 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  52.68 
 
 
346 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.75 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.34 
 
 
344 aa  311  6.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.97 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.96 
 
 
335 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  55.96 
 
 
335 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.82 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.73 
 
 
353 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  55.96 
 
 
335 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  55.2 
 
 
363 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
343 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.04 
 
 
342 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
340 aa  263  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.2 
 
 
361 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.59 
 
 
357 aa  259  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.16 
 
 
365 aa  258  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.59 
 
 
353 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.86 
 
 
351 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.19 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.46 
 
 
344 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42 
 
 
351 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.57 
 
 
353 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.95 
 
 
345 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
344 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
361 aa  170  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
336 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  33.7 
 
 
359 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
349 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.9 
 
 
381 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.9 
 
 
341 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.79 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
344 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
342 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.79 
 
 
354 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
365 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
364 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.11 
 
 
337 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
340 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
336 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
342 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
350 aa  136  5e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.87 
 
 
368 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
336 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.26 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.51 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.28 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
354 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.89 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  28.94 
 
 
348 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.61 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
341 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.95 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
336 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.71 
 
 
342 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
344 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.61 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.8 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.27 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.27 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.91 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.27 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
344 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.83 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.83 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.49 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
337 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
349 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.04 
 
 
342 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.18 
 
 
342 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
342 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
342 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.61 
 
 
375 aa  126  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>