More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1680 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  91.09 
 
 		 349 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  71.1 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.47 
 
 		 347 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.81 
 
 		 346 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.74 
 
 		 347 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.32 
 
 		 346 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  66.47 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  65.98 
 
 		 343 aa  457  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  59.48 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.49 
 
 		 338 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.27 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.02 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.28 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  52.28 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.2 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.59 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.98 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.88 
 
 		 353 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.82 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.74 
 
 		 351 aa  291  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.61 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.72 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 		 353 aa  282  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.58 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.82 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.92 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.66 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.49 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.04 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.76 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.64 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  38.49 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.27 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.27 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.01 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.64 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.27 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.27 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.91 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.91 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.82 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.82 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.77 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.96 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.64 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.92 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.82 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.94 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.13 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.15 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.02 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.95 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.55 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  36.3 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  30 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>