More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68558 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  708    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  80.46 
 
 
348 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08979  Alcohol dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase I)(ADH I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08843]  61.14 
 
 
350 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02286  Alcohol dehydrogenase 3 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase III)(ADH III) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P07754]  58.74 
 
 
352 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264256  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00600  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  48.31 
 
 
422 aa  302  7.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
337 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00710  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  47.89 
 
 
361 aa  291  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.2 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
344 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 
342 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
342 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.2 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 
342 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.25 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
343 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.53 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.69 
 
 
368 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
344 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  42.4 
 
 
342 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.32 
 
 
341 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.32 
 
 
341 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.32 
 
 
341 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.32 
 
 
341 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.32 
 
 
341 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 
342 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.32 
 
 
357 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
340 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.2 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.07 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 
350 aa  269  5e-71  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
342 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.18 
 
 
342 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
342 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.52 
 
 
343 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
340 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.6 
 
 
336 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.4 
 
 
342 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
343 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  41.74 
 
 
342 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.23 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.23 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
344 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  41.59 
 
 
341 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.59 
 
 
337 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
347 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 
344 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.94 
 
 
341 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
341 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.41 
 
 
342 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03741  Alcohol dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase II)(ADH II) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P54202]  41.1 
 
 
367 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.938419  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
341 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.76 
 
 
336 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
336 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.18 
 
 
339 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.98 
 
 
335 aa  216  7e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
341 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
338 aa  209  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
340 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
380 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.31 
 
 
347 aa  206  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
342 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
341 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
336 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
348 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
336 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05913  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase, putative (JCVI)  35.51 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
345 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
347 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
345 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
340 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10358  conserved hypothetical protein  34.73 
 
 
361 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.254844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
336 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.66 
 
 
336 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.24 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
348 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
336 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>