More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5668 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  96.17 
 
 		 339 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 339 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6430  alcohol dehydrogenase  80.36 
 
 		 338 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.400755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.12 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  53.43 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2555  alcohol dehydrogenase  55.36 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.726644  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0372  alcohol dehydrogenase  56.12 
 
 		 342 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 		 343 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0236  alcohol dehydrogenase  54.76 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  47.93 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0669  alcohol dehydrogenase  55.06 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.06 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0491  alcohol dehydrogenase  55.06 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0513  alcohol dehydrogenase  55.06 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.82 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.51 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.84 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.31 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.39 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 		 342 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.51 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.81 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.5 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.75 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.63 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.09 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.4 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.63 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.76 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.72 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.31 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.29 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.29 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.08 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.86 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.69 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.81 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  35.06 
 
 		 346 aa  195  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.99 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  36.04 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.41 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  34.43 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.39 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.94 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.8 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>