More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2391 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  65.56 
 
 
334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  66.07 
 
 
333 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.76 
 
 
334 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.16 
 
 
333 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  60.12 
 
 
333 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.33 
 
 
333 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.68 
 
 
339 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.33 
 
 
333 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.55 
 
 
346 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.1 
 
 
343 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.52 
 
 
335 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  53.94 
 
 
343 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  52.24 
 
 
339 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.24 
 
 
339 aa  338  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  51.94 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  51.94 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.94 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.94 
 
 
339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.64 
 
 
339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.34 
 
 
339 aa  335  7e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.64 
 
 
339 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  51.64 
 
 
339 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  51.34 
 
 
339 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  51.34 
 
 
339 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  50.6 
 
 
339 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  51.34 
 
 
339 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.7 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  51.5 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 
339 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 
338 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
348 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.62 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.35 
 
 
351 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
359 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 
347 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
350 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.76 
 
 
352 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
347 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  35.12 
 
 
348 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
348 aa  235  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.07 
 
 
353 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.91 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  37.18 
 
 
358 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
352 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.24 
 
 
351 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
352 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
347 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
348 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.51 
 
 
348 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.62 
 
 
330 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.07 
 
 
348 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.87 
 
 
352 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 
347 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
348 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
351 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
347 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  39.18 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.43 
 
 
374 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
348 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.8 
 
 
347 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
353 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.13 
 
 
355 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  37.72 
 
 
358 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.29 
 
 
351 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
349 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
350 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.5 
 
 
351 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
350 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
352 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.87 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  38.55 
 
 
408 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
350 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.35 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
354 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
353 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
352 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
352 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
350 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.58 
 
 
351 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.5 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.97 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>