More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05494 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 355 aa  730    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  83.85 
 
 		 353 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.52 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.94 
 
 		 351 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.48 
 
 		 350 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  69.19 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  65.61 
 
 		 352 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  67.14 
 
 		 352 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  66.57 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.54 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.14 
 
 		 351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  64.49 
 
 		 353 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  64.47 
 
 		 353 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  62.5 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  61.81 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.52 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  61.7 
 
 		 350 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  61.52 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.34 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.34 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  60.93 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  59.48 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  60.29 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  61.63 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  61.34 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  60.74 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  61.63 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.6 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.6 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.6 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  61.32 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  61.05 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.91 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  57.35 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.05 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.32 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.6 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  61.05 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.6 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.78 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  59.59 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.47 
 
 		 350 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  57.18 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.46 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.96 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  55.98 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.06 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.48 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  59.43 
 
 		 358 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.78 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  58.56 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.47 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.31 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  58.55 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.33 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.3 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.33 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.36 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  56.25 
 
 		 348 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  56.48 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.14 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.9 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.23 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.5 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.49 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.38 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.81 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  58.16 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.86 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.73 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.73 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.9 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.57 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  56.36 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  54.34 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.6 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.72 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.23 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.03 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.41 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  57.43 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.15 
 
 		 352 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  56.69 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.01 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  57.43 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  53.47 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 		 348 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2634  alcohol dehydrogenase  57.49 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 		 348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.44 
 
 		 346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.15 
 
 		 352 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>