More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3348 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  81.03 
 
 		 347 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  80.46 
 
 		 348 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  80.46 
 
 		 348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  76.72 
 
 		 348 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  63.11 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.61 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  64.52 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.64 
 
 		 347 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  61.78 
 
 		 348 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.25 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.21 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  62.25 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  62.07 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.17 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  63.17 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.08 
 
 		 349 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  63.17 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.36 
 
 		 348 aa  414  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.34 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.33 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.85 
 
 		 350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.18 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.6 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.17 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  58.18 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  57.76 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.3 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.6 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  58.62 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  59.77 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.14 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.74 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.14 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  55.43 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.76 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  57.18 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.48 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  54.6 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.47 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.47 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.47 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  57.18 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.47 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.47 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.47 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.18 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.4 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.36 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.47 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.74 
 
 		 351 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.58 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  58.38 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  55.71 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  53.1 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.93 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.67 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.59 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.02 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.51 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.97 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  54.99 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.64 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.97 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.42 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.94 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 		 350 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  57.91 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.91 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  51.03 
 
 		 348 aa  359  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.2 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  51.73 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.31 
 
 		 349 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.56 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.75 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.83 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 		 347 aa  355  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.83 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  54.31 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  54.34 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.97 
 
 		 348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  55.94 
 
 		 349 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  53.2 
 
 		 352 aa  352  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 		 350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.06 
 
 		 355 aa  351  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  53.45 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 		 352 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.04 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>