More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5967 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
349 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.43 
 
 
348 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.33 
 
 
347 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.33 
 
 
347 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 
347 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  53.91 
 
 
348 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  51.44 
 
 
358 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.43 
 
 
348 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.03 
 
 
347 aa  359  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.44 
 
 
374 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.86 
 
 
349 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.86 
 
 
349 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  52.73 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
359 aa  354  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  51.02 
 
 
348 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.59 
 
 
352 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.7 
 
 
348 aa  349  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.03 
 
 
351 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
348 aa  348  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 
352 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.43 
 
 
351 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  51.74 
 
 
350 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.84 
 
 
353 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.71 
 
 
347 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.56 
 
 
350 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50 
 
 
347 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
350 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
350 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
350 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  50.73 
 
 
348 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  49.85 
 
 
352 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
350 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.16 
 
 
350 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  51.16 
 
 
350 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  51.16 
 
 
353 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  49.56 
 
 
346 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
347 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 
350 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.99 
 
 
348 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.14 
 
 
352 aa  337  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.45 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.16 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  50.87 
 
 
354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.59 
 
 
346 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.16 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.16 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.16 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.16 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.16 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.87 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  50 
 
 
353 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
349 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.57 
 
 
350 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.16 
 
 
354 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 
367 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
350 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.28 
 
 
351 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  49.86 
 
 
350 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.39 
 
 
349 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  48.1 
 
 
348 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.64 
 
 
350 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
350 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.57 
 
 
350 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
351 aa  328  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.99 
 
 
350 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.14 
 
 
360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.99 
 
 
351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.65 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  48.71 
 
 
350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.44 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  50 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  52.63 
 
 
348 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.75 
 
 
350 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  48.24 
 
 
352 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  48.99 
 
 
350 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.04 
 
 
348 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
349 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.57 
 
 
349 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.42 
 
 
353 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
353 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
352 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51 
 
 
352 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  49.13 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.7 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.87 
 
 
355 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.12 
 
 
348 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  51.75 
 
 
348 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
348 aa  317  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49 
 
 
351 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
349 aa  316  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50 
 
 
348 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 
351 aa  315  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2634  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
387 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>