More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3355 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
347 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.1 
 
 
347 aa  557  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.1 
 
 
347 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  79.83 
 
 
367 aa  558  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  62.42 
 
 
350 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.06 
 
 
350 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.63 
 
 
352 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.52 
 
 
351 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  59.83 
 
 
352 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
352 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  59.18 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.14 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  60.35 
 
 
359 aa  411  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.13 
 
 
354 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.21 
 
 
374 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.64 
 
 
348 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  60.63 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.91 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.81 
 
 
347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.83 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  58.4 
 
 
350 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
353 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  57.93 
 
 
348 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  59.48 
 
 
348 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.56 
 
 
347 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  57.83 
 
 
350 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.55 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.62 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.52 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.21 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  57.64 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.81 
 
 
347 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  58.45 
 
 
350 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.17 
 
 
350 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.33 
 
 
350 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.05 
 
 
350 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.18 
 
 
353 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  58.17 
 
 
350 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  55.62 
 
 
352 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
354 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.04 
 
 
348 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 
350 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 
350 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  53.94 
 
 
348 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  58.17 
 
 
351 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.27 
 
 
350 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 
350 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.13 
 
 
352 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.64 
 
 
351 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  56.07 
 
 
350 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.45 
 
 
349 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  59 
 
 
352 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56 
 
 
352 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.7 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  54.23 
 
 
348 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.45 
 
 
349 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.29 
 
 
352 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  55.27 
 
 
350 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.81 
 
 
348 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  58 
 
 
352 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  55.78 
 
 
352 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.76 
 
 
346 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.98 
 
 
354 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.29 
 
 
351 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.81 
 
 
348 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  54.47 
 
 
347 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 
350 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.37 
 
 
355 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 
349 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 
348 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 
352 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
348 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
348 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
352 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  57.93 
 
 
348 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  57.64 
 
 
348 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.67 
 
 
349 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
353 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.33 
 
 
349 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.59 
 
 
350 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  56.59 
 
 
350 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.33 
 
 
348 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  56.59 
 
 
350 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.97 
 
 
351 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.89 
 
 
347 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.15 
 
 
349 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 
348 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  56.81 
 
 
355 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  52.16 
 
 
346 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.75 
 
 
353 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.07 
 
 
351 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>