More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0202 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
352 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.57 
 
 
374 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  71.68 
 
 
358 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  70.89 
 
 
349 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.89 
 
 
349 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  71.84 
 
 
349 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.63 
 
 
349 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5840  alcohol dehydrogenase  70.98 
 
 
349 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 
350 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 
350 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  70.86 
 
 
349 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 
350 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  69.89 
 
 
353 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.14 
 
 
349 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
350 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  70.69 
 
 
349 aa  474  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 
350 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  69.14 
 
 
349 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  70.11 
 
 
349 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.05 
 
 
350 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  68.77 
 
 
350 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  69.54 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.25 
 
 
349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0624  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.6 
 
 
353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.51 
 
 
352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  69.54 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  69.54 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.39 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  67.05 
 
 
350 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.39 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  67.82 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  69.54 
 
 
349 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  68.39 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  69.25 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.39 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  69.25 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.39 
 
 
353 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  68.1 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.39 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  68.97 
 
 
349 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.39 
 
 
354 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.73 
 
 
350 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.93 
 
 
350 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.03 
 
 
351 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  65.33 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  66.08 
 
 
352 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.38 
 
 
351 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  62.54 
 
 
348 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  65.33 
 
 
352 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.75 
 
 
351 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.05 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.98 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 
352 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  59.77 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.14 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.4 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  61.16 
 
 
359 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.43 
 
 
351 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.9 
 
 
352 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.57 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.17 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.9 
 
 
352 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.25 
 
 
355 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.32 
 
 
351 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  58.69 
 
 
353 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.3 
 
 
351 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.8 
 
 
347 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  58.4 
 
 
353 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.18 
 
 
349 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.08 
 
 
352 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.03 
 
 
360 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.94 
 
 
347 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 
347 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.43 
 
 
353 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.74 
 
 
353 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  57.56 
 
 
350 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.15 
 
 
348 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  57.73 
 
 
350 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 
350 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  57.06 
 
 
355 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  57.68 
 
 
350 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.1 
 
 
350 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  53.33 
 
 
348 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  57.27 
 
 
350 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.31 
 
 
349 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
347 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.14 
 
 
348 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.52 
 
 
350 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  56.69 
 
 
350 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  52.46 
 
 
348 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  56.07 
 
 
348 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  56.45 
 
 
351 aa  362  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.34 
 
 
346 aa  361  9e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
348 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  54.76 
 
 
348 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 
347 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  52.46 
 
 
348 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  51.15 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  56.94 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>