More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3779 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
348 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.43 
 
 
349 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.04 
 
 
347 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.62 
 
 
347 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.89 
 
 
347 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  53.41 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54 
 
 
374 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  52.71 
 
 
350 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
348 aa  361  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  54.29 
 
 
358 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.33 
 
 
351 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.67 
 
 
352 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  53.2 
 
 
348 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  52.84 
 
 
350 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.94 
 
 
348 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.7 
 
 
353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 
348 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.29 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50 
 
 
351 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 
347 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.3 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.01 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.3 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.3 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.3 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.3 
 
 
354 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52 
 
 
354 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
350 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.82 
 
 
350 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.14 
 
 
351 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 
353 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 
354 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  53.58 
 
 
353 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  51.01 
 
 
348 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.45 
 
 
348 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  53.41 
 
 
352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  49.86 
 
 
352 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.93 
 
 
350 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
350 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  49.57 
 
 
348 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.56 
 
 
348 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.01 
 
 
349 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 
359 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.01 
 
 
349 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  53.89 
 
 
367 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
349 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
352 aa  339  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  51.59 
 
 
348 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.57 
 
 
351 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50 
 
 
347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.86 
 
 
351 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.99 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.99 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.71 
 
 
349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.14 
 
 
352 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
353 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  49.43 
 
 
352 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.13 
 
 
346 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  51.81 
 
 
350 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.81 
 
 
350 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  51.81 
 
 
350 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
347 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.45 
 
 
355 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
347 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  51 
 
 
351 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.43 
 
 
350 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  48.38 
 
 
348 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  51.43 
 
 
350 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  49.42 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.71 
 
 
350 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
351 aa  328  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 
350 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  51.14 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.31 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  50.87 
 
 
355 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.69 
 
 
349 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  49.12 
 
 
348 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.31 
 
 
347 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  51.14 
 
 
350 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.4 
 
 
346 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.86 
 
 
352 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.57 
 
 
360 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.86 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
350 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  52.16 
 
 
348 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  51.87 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.36 
 
 
352 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
352 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.73 
 
 
351 aa  315  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.29 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  50.72 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  49 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>