More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3042 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  97.43 
 
 		 350 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  90.83 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  90.83 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  98.86 
 
 		 350 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  89.97 
 
 		 354 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  97.71 
 
 		 350 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  91.98 
 
 		 354 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  90.83 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  98.86 
 
 		 350 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  99.71 
 
 		 350 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  90.83 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  90.54 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  98.86 
 
 		 350 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  90.83 
 
 		 354 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  84.57 
 
 		 350 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  86.86 
 
 		 350 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  82.52 
 
 		 350 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.86 
 
 		 350 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.93 
 
 		 352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  73.14 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.43 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  70.57 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  69.25 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.77 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.14 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.54 
 
 		 351 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  66.47 
 
 		 359 aa  447  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  64.76 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.4 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.14 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.57 
 
 		 351 aa  437  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  66.48 
 
 		 349 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.79 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  65.7 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  65.8 
 
 		 349 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.43 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.88 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  63.95 
 
 		 353 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.03 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.35 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  63.95 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  64.93 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  64.74 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.42 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  64.37 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0624  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.9 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.23 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.74 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.86 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.14 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  60.46 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.97 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.46 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.27 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.48 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.08 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  59.71 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5840  alcohol dehydrogenase  63.69 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.17 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  61.21 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.57 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  63.95 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.95 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.75 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.39 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  58.72 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  60.46 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  63.95 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  63.66 
 
 		 349 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  63.95 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.92 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  64.24 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  63.95 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.28 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  60.46 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  63.37 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.4 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  60 
 
 		 351 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.02 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  61.34 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  58.45 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  59.89 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  56.07 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  55.46 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  58.62 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.83 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  58.5 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  60.92 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  60.92 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  57.19 
 
 		 350 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  56.57 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.73 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.46 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>