More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0401 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 352 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  93.47 
 
 		 352 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  83.73 
 
 		 352 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  75.57 
 
 		 352 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  76.35 
 
 		 352 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  76.07 
 
 		 352 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  74.07 
 
 		 352 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  66.57 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.81 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.07 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.16 
 
 		 351 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.96 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  62.82 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  61.97 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.34 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.34 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  61.06 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  61.97 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.06 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.98 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.34 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  61.97 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.34 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.34 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  61.82 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.04 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.54 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.81 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.13 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  61.13 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  61.13 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.56 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  56.53 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.43 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.43 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.12 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.56 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  61.41 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.17 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.41 
 
 		 374 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.65 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.81 
 
 		 351 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.97 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  56.41 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.71 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  55.52 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.13 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.96 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.86 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  58.5 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.93 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.37 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  57.47 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.83 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.47 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.91 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.71 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  57.06 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.71 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  53.82 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.99 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  52.17 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5840  alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.57 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.21 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  54.11 
 
 		 352 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.55 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.67 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  57.51 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  53.35 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  54.08 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  57.06 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  57.06 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.35 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.77 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.06 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  56.78 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.77 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.77 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  56.2 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  57.69 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  56.06 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  55.4 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.01 
 
 		 347 aa  358  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  54.67 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.42 
 
 		 347 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.29 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  52.57 
 
 		 346 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>