More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0114 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
348 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.7 
 
 
349 aa  534  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.68 
 
 
346 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  71.68 
 
 
347 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  68.5 
 
 
348 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.67 
 
 
347 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.36 
 
 
348 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.76 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.26 
 
 
347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  64.84 
 
 
348 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  63.98 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.56 
 
 
348 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  65.77 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.77 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  65.77 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.51 
 
 
348 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  60.69 
 
 
346 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.89 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  58.09 
 
 
347 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 
348 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  58.6 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  58.45 
 
 
358 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.15 
 
 
348 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  54.62 
 
 
347 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  55.62 
 
 
350 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  52.48 
 
 
348 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  52.77 
 
 
348 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  52.77 
 
 
348 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.74 
 
 
347 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.3 
 
 
347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.72 
 
 
353 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.03 
 
 
351 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 
354 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.01 
 
 
347 aa  348  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  54.09 
 
 
358 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.74 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  54.02 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.02 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.6 
 
 
374 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.02 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.02 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.02 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.28 
 
 
351 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  52.6 
 
 
352 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
352 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.31 
 
 
350 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.16 
 
 
353 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 
367 aa  343  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.45 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.45 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.43 
 
 
352 aa  342  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
352 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
346 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
350 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  53.6 
 
 
359 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
350 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.16 
 
 
354 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
350 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
352 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.02 
 
 
347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.72 
 
 
351 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
350 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
350 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.29 
 
 
350 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.64 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  52.01 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.74 
 
 
354 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.72 
 
 
347 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 
350 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 
352 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  51.43 
 
 
352 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  50.57 
 
 
350 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.72 
 
 
350 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
349 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.57 
 
 
350 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.31 
 
 
351 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.71 
 
 
351 aa  332  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.72 
 
 
351 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  52.31 
 
 
355 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.72 
 
 
349 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.08 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.18 
 
 
349 aa  328  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.6 
 
 
355 aa  328  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 
353 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.45 
 
 
352 aa  325  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.8 
 
 
350 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
353 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
349 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 
349 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
350 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49 
 
 
350 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 
349 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.01 
 
 
351 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  49 
 
 
350 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  49 
 
 
350 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  51.16 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.71 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.59 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>