More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4527 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
346 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  56.65 
 
 
347 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.91 
 
 
346 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.05 
 
 
349 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  53.47 
 
 
347 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  54.47 
 
 
348 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.89 
 
 
348 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  54.94 
 
 
350 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.33 
 
 
347 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.62 
 
 
350 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  54.62 
 
 
350 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
348 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  53.2 
 
 
348 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.01 
 
 
347 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  52.31 
 
 
346 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.94 
 
 
348 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.89 
 
 
348 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.71 
 
 
346 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 
347 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.29 
 
 
348 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
350 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.84 
 
 
348 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.55 
 
 
348 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  47.41 
 
 
348 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.99 
 
 
351 aa  326  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.22 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.65 
 
 
351 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.7 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.74 
 
 
352 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.06 
 
 
350 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.53 
 
 
347 aa  316  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.31 
 
 
351 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.71 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.73 
 
 
358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.86 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.86 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.86 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.54 
 
 
348 aa  312  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.86 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.86 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.57 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  48.57 
 
 
354 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.97 
 
 
347 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  47.25 
 
 
359 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.14 
 
 
349 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
350 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.71 
 
 
351 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.66 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.24 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
348 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.13 
 
 
349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.13 
 
 
349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  43.23 
 
 
352 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.24 
 
 
374 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.22 
 
 
350 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.11 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0343  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.082465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.43 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.34 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.07 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.7 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.56 
 
 
354 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  48.52 
 
 
352 aa  301  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
350 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  44 
 
 
352 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.59 
 
 
352 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
350 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  47.23 
 
 
348 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
350 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
350 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
350 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
351 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.29 
 
 
353 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
350 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
349 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  47.58 
 
 
353 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  47.86 
 
 
353 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.01 
 
 
350 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
350 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  46.72 
 
 
350 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.55 
 
 
349 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
352 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1719  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.09 
 
 
358 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
353 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5840  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 
349 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1533  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.09 
 
 
358 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.712764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  45.56 
 
 
350 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.01 
 
 
351 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.99 
 
 
350 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.99 
 
 
349 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.29 
 
 
352 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
352 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>