More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3212 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.09 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  57.47 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  57.39 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.16 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.51 
 
 		 346 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.85 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.39 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  57.18 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.4 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  58.98 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.98 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  58.98 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  56.65 
 
 		 346 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  55.78 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.36 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.76 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.62 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.3 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  51.01 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.28 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.08 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.84 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.21 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 350 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.28 
 
 		 354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.14 
 
 		 349 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.14 
 
 		 349 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.76 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 		 374 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.35 
 
 		 351 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  48.71 
 
 		 350 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 		 352 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  49.43 
 
 		 358 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.66 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  50.43 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  50 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.55 
 
 		 348 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.43 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.15 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.43 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.43 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.43 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.43 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  48.49 
 
 		 352 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.82 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 		 359 aa  325  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  48.15 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.59 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.29 
 
 		 351 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.23 
 
 		 352 aa  322  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.14 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.13 
 
 		 351 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 352 aa  321  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.39 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.58 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.01 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.69 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.58 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  51.28 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  51.28 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.41 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51 
 
 		 349 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  46.7 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  47.28 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51 
 
 		 349 aa  315  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.71 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  46.42 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.42 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  46.42 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  49.57 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.7 
 
 		 347 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 350 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.57 
 
 		 352 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.13 
 
 		 350 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.57 
 
 		 347 aa  311  9e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.41 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.67 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>