More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3956 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 
334 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  69.07 
 
 
333 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.17 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.17 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.63 
 
 
333 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.14 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.14 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  60.42 
 
 
333 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.33 
 
 
335 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.18 
 
 
339 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.96 
 
 
343 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 
343 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.06 
 
 
346 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  53.59 
 
 
339 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  53.59 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  53.59 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.59 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.59 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.29 
 
 
339 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.29 
 
 
339 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.29 
 
 
339 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.29 
 
 
339 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  53.59 
 
 
339 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  53.29 
 
 
339 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  53.59 
 
 
339 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  53.29 
 
 
339 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  53.29 
 
 
339 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  52.25 
 
 
339 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.9 
 
 
339 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.3 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.39 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.65 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
348 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
348 aa  242  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
347 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.8 
 
 
348 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.59 
 
 
335 aa  240  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
347 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
348 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
359 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
348 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.24 
 
 
351 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.24 
 
 
348 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
348 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  35.91 
 
 
348 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  39.05 
 
 
352 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.35 
 
 
350 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 
347 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
348 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  37.75 
 
 
358 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 
349 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
351 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  39.77 
 
 
353 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
350 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.57 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.36 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.41 
 
 
353 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.91 
 
 
347 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  39.52 
 
 
408 aa  223  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.17 
 
 
350 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
353 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
351 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
353 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
352 aa  222  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
350 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.31 
 
 
348 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.01 
 
 
348 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
350 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
350 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
350 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
350 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.28 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
350 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 
347 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.42 
 
 
354 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.61 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.83 
 
 
350 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
347 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.87 
 
 
350 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.83 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.12 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.12 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.12 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.12 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.12 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.14 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.63 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>