More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04135 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  100 
 
 		 339 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  98.82 
 
 		 339 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  99.71 
 
 		 339 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  98.82 
 
 		 339 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  99.41 
 
 		 339 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  98.53 
 
 		 339 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  703    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  98.82 
 
 		 339 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  98.82 
 
 		 339 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  91.15 
 
 		 339 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  91.45 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  91.15 
 
 		 339 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  91.15 
 
 		 339 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  90.86 
 
 		 339 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  89.97 
 
 		 339 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.07 
 
 		 339 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  82.3 
 
 		 339 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.61 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.61 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.55 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.03 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  54.19 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.94 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.55 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.6 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.3 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  53.59 
 
 		 334 aa  338  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.4 
 
 		 343 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 		 343 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.49 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.13 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.04 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.28 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.39 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.9 
 
 		 348 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 		 348 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 348 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 		 347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  37.28 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.39 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  38.78 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.93 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 353 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.12 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.88 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.9 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.58 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.06 
 
 		 350 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.17 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.41 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.52 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.61 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.73 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.23 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  35.51 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  35.59 
 
 		 350 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.45 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 		 359 aa  205  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.6 
 
 		 354 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  35.17 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.23 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.23 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.23 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>