More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3359 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
330 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.34 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.44 
 
 
333 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.44 
 
 
333 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
343 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.9 
 
 
343 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
333 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.95 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.01 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.18 
 
 
335 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  41.57 
 
 
334 aa  241  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  42.47 
 
 
333 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.39 
 
 
339 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.39 
 
 
339 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
339 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  42.39 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.39 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.39 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.09 
 
 
339 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  41.79 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  41.79 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.39 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.09 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.59 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.6 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.12 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
348 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
347 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
348 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.83 
 
 
346 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  38.41 
 
 
350 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.19 
 
 
348 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
348 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
348 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.94 
 
 
351 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
348 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
347 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 
346 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  33.91 
 
 
358 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.6 
 
 
353 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
348 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
353 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
349 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1098  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.68 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.59 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
347 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0343  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
360 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.082465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.11 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.94 
 
 
352 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.91 
 
 
348 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1533  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.25 
 
 
358 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.712764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
347 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
352 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  34.02 
 
 
346 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.21 
 
 
347 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  36.42 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 
335 aa  180  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.29 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1719  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.63 
 
 
358 aa  179  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
351 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  31.69 
 
 
348 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
347 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.73 
 
 
348 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1905  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.75 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
352 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5027  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.55 
 
 
344 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.83 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.29 
 
 
351 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
352 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.28 
 
 
351 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
348 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
349 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02940  alcohol dehydrogenase (NADP+), putative  37.54 
 
 
367 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.013941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
349 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  35.04 
 
 
349 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  35.04 
 
 
349 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
352 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
349 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
359 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.04 
 
 
349 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.76 
 
 
349 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 
352 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.76 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>