More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1400 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
346 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  63.44 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.81 
 
 
343 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  58.01 
 
 
343 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.88 
 
 
334 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
333 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.56 
 
 
335 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.76 
 
 
333 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.76 
 
 
333 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  56.67 
 
 
333 aa  371  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.55 
 
 
333 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  56.06 
 
 
334 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.69 
 
 
339 aa  364  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.51 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  51.92 
 
 
339 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.33 
 
 
339 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.33 
 
 
339 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  51.33 
 
 
339 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.33 
 
 
339 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  51.62 
 
 
339 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  51.62 
 
 
339 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  51.92 
 
 
339 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  51.62 
 
 
339 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.03 
 
 
339 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  51.03 
 
 
339 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.74 
 
 
339 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  51.03 
 
 
339 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  51.33 
 
 
339 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.74 
 
 
339 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.74 
 
 
339 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.26 
 
 
339 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1987  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.07 
 
 
214 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  38.51 
 
 
358 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.01 
 
 
330 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
348 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.39 
 
 
351 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  40.97 
 
 
408 aa  235  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.82 
 
 
374 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
350 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
348 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  37.54 
 
 
358 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.38 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
348 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
347 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
350 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
350 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
347 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  34.39 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.39 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
354 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.57 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.57 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.57 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.57 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.28 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.57 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
352 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
348 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.57 
 
 
354 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.4 
 
 
347 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.1 
 
 
350 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.28 
 
 
350 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
348 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.05 
 
 
349 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.22 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.15 
 
 
352 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.52 
 
 
350 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
350 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
347 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
348 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
352 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.97 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.5 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.6 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.6 
 
 
349 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  38.6 
 
 
349 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
349 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.21 
 
 
348 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
350 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.6 
 
 
349 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.69 
 
 
350 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.6 
 
 
349 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
350 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
350 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>