More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5027 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5027  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
344 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2621  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.58 
 
 
347 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  51.95 
 
 
352 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.69 
 
 
351 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.07 
 
 
348 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 
348 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.78 
 
 
353 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
352 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
348 aa  309  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.06 
 
 
350 aa  308  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
353 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  47.72 
 
 
351 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.83 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  48.17 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
352 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
350 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
350 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.67 
 
 
360 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  44.7 
 
 
350 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 
350 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.42 
 
 
350 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 
350 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.81 
 
 
350 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.11 
 
 
350 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.99 
 
 
350 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.76 
 
 
351 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  44.7 
 
 
350 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.11 
 
 
350 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 
350 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
348 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
350 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.13 
 
 
350 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.28 
 
 
346 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
347 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.29 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.99 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.96 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.43 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.43 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  43.55 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
350 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.21 
 
 
349 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.09 
 
 
346 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.27 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.27 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.27 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.98 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.27 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.27 
 
 
354 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
354 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.73 
 
 
351 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.12 
 
 
347 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05494  putative NADP-dependent zinc-type alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  45.99 
 
 
355 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.378039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
353 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.23 
 
 
347 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.95 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
352 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.63 
 
 
355 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.35 
 
 
349 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.33 
 
 
348 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 
348 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.21 
 
 
351 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
352 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.44 
 
 
352 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.79 
 
 
351 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
346 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
349 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.94 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.14 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  40.36 
 
 
346 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  41.02 
 
 
348 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.95 
 
 
347 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1162  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
347 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.71 
 
 
348 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.5 
 
 
352 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 
352 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.65 
 
 
347 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.27 
 
 
348 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
367 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.99 
 
 
352 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.03 
 
 
358 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 
351 aa  255  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.69 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  43.1 
 
 
348 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  43.1 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  38.91 
 
 
348 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>