More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6441 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  98.54 
 
 		 343 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  79.94 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  68.73 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  52.25 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.25 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.97 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.97 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6430  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.400755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2555  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.726644  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0669  alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.72 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0491  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0513  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0236  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0372  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.39 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.89 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.04 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.8 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.81 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  35.19 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.72 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.01 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.25 
 
 		 342 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.05 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.67 
 
 		 348 aa  185  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 348 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.17 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.76 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  34.29 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  34.71 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  32.61 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.07 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.46 
 
 		 357 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.46 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.46 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.46 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.46 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.46 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.94 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.98 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  36.72 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.04 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.95 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.55 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.9 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.06 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.42 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.64 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>