More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1066 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
339 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  96.17 
 
 
339 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6430  alcohol dehydrogenase  80.06 
 
 
338 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.400755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.12 
 
 
338 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  52.54 
 
 
336 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  55.79 
 
 
348 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2555  alcohol dehydrogenase  54.76 
 
 
339 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.726644  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0372  alcohol dehydrogenase  55.22 
 
 
342 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  51.49 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0236  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  48.22 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0669  alcohol dehydrogenase  54.76 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54082  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.46 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0491  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0513  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.52 
 
 
335 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
343 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.98 
 
 
342 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
342 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.4 
 
 
336 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.28 
 
 
342 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
336 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
341 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.28 
 
 
343 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
342 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.39 
 
 
342 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.69 
 
 
342 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
342 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.91 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
342 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.6 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
344 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
342 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  37.87 
 
 
344 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.61 
 
 
337 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
341 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.64 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.95 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.95 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.5 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.14 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
348 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
342 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.61 
 
 
357 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.33 
 
 
336 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
341 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.61 
 
 
341 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
337 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.61 
 
 
341 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
341 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
341 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
344 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.99 
 
 
341 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.46 
 
 
350 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
350 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
350 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
343 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
347 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
340 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.94 
 
 
334 aa  202  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
348 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  35.06 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
333 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
347 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.52 
 
 
348 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.71 
 
 
346 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
368 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
348 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 
348 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
342 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  35.44 
 
 
333 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.42 
 
 
342 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
348 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
350 aa  189  5e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.33 
 
 
340 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
338 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.94 
 
 
335 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  34.13 
 
 
334 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
348 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>